La Eurociudad cuenta con una Presidencia, dos Vicepresidencias, el Consejo Plenario y Comités Sectoriales (Turismo, Cultura, Asuntos Sociales, Transición hacia una economía baja en carbono).
La Presidencia corresponde al presidente de la Cámara Municipal de Campo Maior, João Marciano Azinhais Muacho. Son Vicepresidentes, Nuno Miguel Fernándes Mocinha, presidente de la Cámara de Elvas y Francisco Javier Fragoso Martínez Alcalde de Badajoz.